Se creó mediante la Ley No. 318 del 26 de abril de 1972. Sus principales funciones son realizar investigaciones antropológicas, etnológicas y de arqueología precolombina en el país, además de mantener y conservar una exposición de objetos representativos de la cultura dominicana que cumpla con un propósito didáctico. Además, mantener un inventario de los fondos de su colección y editar publicaciones de los resultados de sus investigaciones. El museo lleva a cabo diversas actividades, como la exposición permanente de piezas, ciclos de conferencias, presentaciones de libros de sus investigaciones y cursos. Está ubicado en la Plaza de la Cultura Juan Pablo Duarte, en Santo Domingo.