Establecida por Decreto Presidencial 3297-57 en el año 1957, como dependencia de la Secretaría de Estado de Bellas Artes y Cultos de ese entonces, para actuar como el punto focal entre el país y la Unesco en los asuntos relacionados con las acciones de esa organización en el territorio dominicano. A partir del año 2000, la actual Comisión Nacional se encuentra bajo la tutela administrativa del Ministerio de Cultura, fungiendo el ministro de Cultura como su presidente. La CNDU trabaja en cooperación con el Gobierno y la sociedad civil con el objetivo de desarrollar y llevar a efecto las políticas de la Unesco en la República Dominicana, efectuar reformas dentro de la Unesco y aumentar la visibilidad de los valores e ideales de la organización. Se encuentra ubicada en la Biblioteca Nacional Pedro Henríquez Ureña, en la Plaza de la Cultura Juan Pablo Duarte de la ciudad de Santo Domingo.
